تتخذ مرجعية السيستاني في محافظة النجف مواقف متباينة تثير حفيظة العراقيين، لاسيما بعد موقفها في قضية أراضي الجادرية ببغداد وإدانتها لسطوة ميليشيا الحشد التي استولت على أراضيهم.
وتقف المرجعية دون حراك أمام عشرات القضايا الأخرى من تهجير قسري وتغيير ديموغرافي وفساد، وأبرزها قضية جرف الصخر رغم مرور 9 سنوات على أزمتها.