يعاني مياه نهر دجلة من تلوث كبير منذ نحو عقدين من الزمن، بسبب المياه الثقيلة التي ترمى فيها والتي تقدر بملايين الأطنان، ما تسبب بأضرار صحية خطيرة على المواطنين.
وباتت مياه دجلة مصدر أساس للتلوث وانتشار الأمراض والأوبئة، ويعود ذلك إلى كمية الملوثات والنفيات التي ترمى في النهر، بالإضافة إلى الإهمال الحكومي المستمر منذ سنوات عديدة.
ومن أبرز المؤسسات الحكومية التي ترمى نفاياتها في نهر دجلة ، هي وزارة الصناعة، ووزارة الصحة، ووزارة الإعمار والإسكان ووزارة الكهرباء، وغيرها.